1、運作模式不同：棚户區改造採用“政府主導+國企實施+人才住房”的模式，温州平陽昆陽鎮就屬於棚户區改造；舊改遵循“政府引導、市場運作、公眾參與”的原則，深圳南山大沖村改造項目走的則是舊改模式。
2、強制性不同：棚改實施過程中，因涉及到公共安全的相關利益，對於少數不服從改造的，都是可以通過行政徵收、行政處罰程序等強制執行；舊改則完全遵循自願原則，必須百分之百的業主同意方可拆除動工。
3、更改對象不同：棚改對象為全市範圍內使用年限在20年以上、存在住房質量安全隱患、使用功能不齊全、配套設施也都不怎麼完善的老舊住宅區項目；舊改對象為舊住宅區申請拆除重建城市更新的，建築物建成時間原則上應不少於20年，滿足條件的舊商業區、舊工業區建築物可放寬至15年的建成時間要求。
4、配建要求不同：棚改除滿足拆遷安置的一個需要外，其餘住房均都會配建為人才住房和保障型住房，且堅持以租為主，根據轄區人才住房和保障性住房的建設供應情況，確定租售比例；舊改則按規定比例配建，無全部配建保障房的要求，可建商品房。
