1、材料不一样：pu漆的主材是聚氨酯；而水性漆则是环氧树脂。2、环保性不一样：pu漆在制作时添加了固化剂等有毒物质，环保性差；而水性漆在调漆时使用了清水，无毒环保。3、性能不同：pu漆外观饱满，通透性差；而水性漆外观通透，且质地细腻。
pu漆的特点
1、化学性干燥，按配比操作。
2、综合性能好；硬度好、丰满度好、附着力好、耐久性好、手感好。漆膜较薄不是很硬；但其附着力特别好；其光泽均称，看上去不是很亮，可以很好的显示地板的纺理和色泽。
3、配好后有一定的使用期限。
4、PU漆普遍被工业和建筑使用，所以技术成熟，色系多，容易达到喷涂要求。但由于对人体有害，所以对喷漆房、烤漆房的要求较高，并同时需要加以人体防护措施。
水性漆的优点
1、以水作溶剂，节省大量资源；消除了施工时火灾危险性；降低了对大气污染。
2、水性涂料在湿表面和潮湿环境中可以直接涂覆施工；对材质表面适应性好，涂层附着力强。
3、涂装工具可用水清洗，大大减少清洗溶剂的消耗，并有效减少对施工人员的伤害。
4、电泳涂膜均匀、平整。展平性好；内腔、焊缝、棱角、棱边部位都能涂上一定厚度的涂膜，有很好的防护性；电泳涂膜有最好的耐腐蚀性，厚膜阴极电泳涂层的耐盐雾性最高可达1200h。
