第一，笔头：马克笔的笔头是扁的；水彩笔笔头是圆的。第二，种类：马克笔分水性和油性2种；水彩笔只有1种水性。第三，外形：马克笔笔头和笔杆则为扁的方形，也是由笔杆、笔芯、笔尖三部分构成；水彩笔笔头和笔杆均为圆形，由笔杆、笔芯、笔尖三部分构成。
马克笔分为油性马克笔和水性马克笔两种，油性马克笔多用于一次性的快速绘图，干的很快，耐水、耐干。虽然不能溶于水，但是能溶于酒精，如果笔干掉了，在笔芯里加入点酒精又可以接着用一段时间。
而且马克笔这种画具在设计用品店就可以买到，而且只要打开盖子就可以画，不限纸材、各种素材都可以上色。
水彩笔有单色水彩笔、双色水彩笔和多色水彩笔，单色水彩笔只有颜色的区别，有12色、24色、36色等色号。双色水彩笔书写起来有2种颜色。多色水彩笔是由多种颜色的笔芯合在一起做成一个笔头，常用于美工作画。
